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南宫28实时荧光定量PCR应用与数据分析:相对定量与绝对定量探讨

来源:萧伦行 日期:2025-03-15

第三章:实时荧光定量PCR的应用

南宫28实时荧光定量PCR应用与数据分析:相对定量与绝对定量探讨

一、相对定量测定不同样品中基因表达量的相对值

在进行基因表达的相对定量测定时,内参基因的选择非常关键。如以下几点:

  1. 始终选择表达丰盛且稳定的基因作为内参基因。
  2. 请勿盲目选择常用的内参基因。
  3. 常用的内参基因包括:GAPDH、Actin、Tublin。

内参基因的适当选择直接关系到实验结果的有效性。引入内参基因后,可以进行结果的计算。

二、绝对定量

绝对定量是根据标准品测定样品中基因表达的绝对值(拷贝数)。

标准品的选择包括:

  1. A/克隆质粒
  2. B/PCR产物
  3. C/cDNA(进行扩增效率测定等用途,但绝对定量时不建议使用)

拷贝数的计算需要考虑平均分子量(MW)。具体计算方式如下:

  • 双链DNA(dsDNA):拷贝数 = (碱基数) x (660道尔顿/碱基)
  • 单链DNA(ssDNA):拷贝数 = (碱基数) x (330道尔顿/碱基)
  • 单链RNA(ssRNA):拷贝数 = (碱基数) x (340道尔顿/碱基)

拷贝数计算公式为:

(6.02 x 10²³ 拷贝数/摩尔) x (浓度 g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml

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